長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長度超過200nt的RNA,它們本身并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達水平。近年來的研究表明:LncRNA廣泛參與各種生物學(xué)過程,LncRNA的異常表達與包括癌癥在內(nèi)的多種疾病密切相關(guān)。通過LncRNA seq,研究人員能夠快速高通量的獲得與特定生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達變化,從而為后續(xù)的LncRNA功能研究或生物標(biāo)志物篩選提供極大的便利。
樣本類型 | 建議送樣量 | 存儲介質(zhì) | 保存、運輸條件 |
組織 | >50mg | 1.RNA later; 2.存入凍存管; 3.大塊組織樣本不建議放入trizol保存; 4.1.5ml無菌離心管 | -80℃保存,干冰運輸 |
細胞 | >2 x 10^6 | 1.收集的細胞沉淀,加入1ml trizol震蕩混勻-80度保存; 2.收集的細胞沉淀,液氮速凍5-10min,-80℃冰箱保存; | -80℃保存,干冰運輸 |
全血 | >1ml | A.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鮮血液效果更佳。 B.或者分離出PBMC加 trizol 混勻。 C.或者全血離心去掉血漿加 trizol 混勻。 D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube靜脈真空采血管(全血RNA管) PS:請盡量不使用RNA later保存全血。 | -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運輸 |
FFPE | A.切片組織面積大于1cm2,切片表面無劃痕,無干裂,均勻貼片的石蠟切片; B.切片組織細胞>30000個;有核細胞比例>80%;腫瘤細胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細胞核占比未達80%以上,需提供5-12片; C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上; D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷 | / | 4℃或常溫保存和運輸 |
RNA | >1ug | DEPC水;Water Nuclease-Free | -80℃保存,干冰運輸 |