轉(zhuǎn)錄組測序
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LncRNA測序
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  • 產(chǎn)品描述

    長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長度超過200nt的RNA,它們本身并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達水平。近年來的研究表明:LncRNA廣泛參與各種生物學(xué)過程,LncRNA的異常表達與包括癌癥在內(nèi)的多種疾病密切相關(guān)。通過LncRNA seq,研究人員能夠快速高通量的獲得與特定生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達變化,從而為后續(xù)的LncRNA功能研究或生物標(biāo)志物篩選提供極大的便利。

    產(chǎn)品優(yōu)勢
    1、通量高、敏感性高的技術(shù),對于多基因分析具有獨特的優(yōu)勢
    2、全基因組分析,無需預(yù)先設(shè)計特異性探針能夠檢測未知基因
    3、低成本,高準(zhǔn)確性,大幅降低了測序時間
    4、數(shù)字化信號,直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列,單核苷酸分辨率的精確度
    5、利用高深度的測序數(shù)據(jù)組裝構(gòu)建轉(zhuǎn)錄本序列,識別可變剪接模式
    實驗流程

  • 數(shù)據(jù)分析

  • 樣本類型建議送樣量存儲介質(zhì)保存、運輸條件
    組織>50mg1.RNA later;
    2.存入凍存管;
    3.大塊組織樣本不建議放入trizol保存
    4.1.5ml無菌離心管
    -80℃保存,干冰運輸
    細胞>2 x 10^61.收集的細胞沉淀,加入1ml trizol震蕩混勻-80度保存;
    2.收集的細胞沉淀,液氮速凍5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰運輸
    全血>1mlA.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鮮血液效果更佳。
    B.或者分離出PBMC加 trizol 混勻。
    C.或者全血離心去掉血漿加 trizol 混勻。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube靜脈真空采血管(全血RNA管)
    PS:請盡量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運輸
    FFPEA.切片組織面積大于1cm2,切片表面無劃痕,無干裂,均勻貼片的石蠟切片;
    B.切片組織細胞>30000個;有核細胞比例>80%;腫瘤細胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細胞核占比未達80%以上,需提供5-12片;

    C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上;
    D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷
    /4℃或常溫保存和運輸
    RNA>1ugDEPC水;Water Nuclease-Free-80℃保存,干冰運輸
  • 研究方向/思路

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