基因組重測序(Re-Sequencing)是對已知基因組序列信息的個體進(jìn)行測序,可在此基礎(chǔ)上對個體或群體進(jìn)行基因型差異性分析。主要用于發(fā)現(xiàn)大量的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP)、拷貝數(shù)變異(Copy Number Variation,CNV)、插入缺失(InDel,Insertion/Deletion)等變異位點(diǎn),以高效準(zhǔn)確獲得生物群體的遺傳特征,并方便進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)性分析(GWAS),在人類疾病和動植物育種研究等方面意義重大。
1、分析方法靈活,快速鑒定多種類型的遺傳變異
2、全基因組分析,揭示個體的全部基因組序列,包括基因和非編碼區(qū)域
3、低成本,高準(zhǔn)確性,高通量
4、實驗及分析周期短,快速地確定生物體的完整基因組序列
樣本類型 | 建議送樣量 | 保存、運(yùn)輸介質(zhì) |
組織 | >50mg | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |
細(xì)胞 | >2 x 10^6 | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |
血液 | >1ml | -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運(yùn)輸 |
FFPE | A.切片組織面積大于1cm2,切片表面無劃痕,無干裂,均勻貼片的石蠟切片; B.切片組織細(xì)胞>30000個;有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片; C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上; D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷 | 4℃或常溫保存和運(yùn)輸 |
唾液 | >1ml,盡量收集較多的細(xì)胞 | 常溫或4℃運(yùn)輸 |
口腔拭子 | 1.5ml管 2管,或5ml管1管 | 常溫或4℃運(yùn)輸 |
gDNA | >1ug | -80℃保存,干冰運(yùn)輸 |