轉(zhuǎn)錄組測序
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Smart(微量)轉(zhuǎn)錄組測序
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  • 產(chǎn)品描述

    Smart-seq2技術(shù)可以在單細(xì)胞水平對帶Poly (A)的RNA進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組擴(kuò)增及高通量測序,能夠滿足高靈敏度、低偏好性的cDNA擴(kuò)增,得到全長轉(zhuǎn)錄本,實(shí)現(xiàn)高水平的序列模板轉(zhuǎn)換。Smart-seq2技術(shù)有較好的覆蓋范圍,可檢測到稀有轉(zhuǎn)錄本,無需額外的專業(yè)設(shè)備,應(yīng)用范圍較廣,可以解決傳統(tǒng) RNA定量技術(shù)在早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、癌癥、免疫等研究領(lǐng)域中存在的樣品量極低或細(xì)胞異質(zhì)性的問題,是在單細(xì)胞水平研究基因表達(dá)強(qiáng)有力的工具,極大地拓展了RNA-seq 的應(yīng)用范圍。

    產(chǎn)品優(yōu)勢
    (1)起始量低:1-1000個細(xì)胞或10pg-10ng total RNA即可高效擴(kuò)增;
    (2)轉(zhuǎn)錄本覆蓋度高:通過雙端引物擴(kuò)增全長cDNA,獲得全轉(zhuǎn)錄組信息,避免3'端和5'端偏好性,產(chǎn)物完整性好;
    (3)檢測靈敏度高:大幅度增加了低表達(dá)基因的檢出量;
    (4)堿基分辨率高:可達(dá)單堿基分辨率,且可以定位到具體基因的具體轉(zhuǎn)錄本;
    (5)實(shí)驗(yàn)可控:質(zhì)控點(diǎn)多,可從實(shí)驗(yàn)的開端判斷細(xì)胞狀況。
    實(shí)驗(yàn)流程


  • 數(shù)據(jù)分析


  • 樣本類型建議送樣量存儲介質(zhì)保存、運(yùn)輸條件
    細(xì)胞>1個細(xì)胞旭燃裂解液100ul-80℃保存,干冰運(yùn)輸(最多提供1×106 個細(xì)胞,超出這個范圍會產(chǎn)生基因組和蛋白污染的問題。最低可提供1個細(xì)胞,需要確定細(xì)胞活性。該項(xiàng)目只適合真核生物,也不適用固定細(xì)胞,和固定后的組織切割細(xì)胞。)
    RNA>20ng/-80℃保存,干冰運(yùn)輸
  • 研究方向/思路


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