全轉(zhuǎn)錄組即特定細(xì)胞或組織在某一功能狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 (mRNA、 LncRNA、 CircRNA 以及 microRNA) 的合集。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可對(duì)同一個(gè)樣品同時(shí)進(jìn)行 mRNA、 LncRNA、 CircRNA 和 microRNA 的單獨(dú)分析，還可進(jìn)行多種 RNA聯(lián)合分析以及內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性 RNA 整合分析，分子標(biāo)記篩選等，探究其潛在的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)機(jī)制，全面的揭示轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。主要應(yīng)用于免疫機(jī)制、疾病領(lǐng)域、發(fā)育進(jìn)化、致病機(jī)理和藥物靶標(biāo)等方面的研究。
全轉(zhuǎn)錄組是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的一站式解決方案，對(duì)一份樣品建兩個(gè)文庫(kù)，獲取 4 種 RNA 的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分別分析與聯(lián)合分析，并對(duì) LncRNA 與 CricRNA 這類具有 microRNA 結(jié)合位點(diǎn)的非編碼 RNA 進(jìn)行 ceRNA 分析，深度挖掘基因功能及調(diào)控機(jī)制，解析 RNA 分子間調(diào)控模式。
3、低成本，高準(zhǔn)確性，大幅降低了測(cè)序時(shí)間
4、數(shù)字化信號(hào)，直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列,單核苷酸分辨率的精確度
5、利用高深度的測(cè)序數(shù)據(jù)組裝構(gòu)建轉(zhuǎn)錄本序列,識(shí)別可變剪接模式
| 樣本類型 | 建議送樣量 | 存儲(chǔ)介質(zhì) | 保存、運(yùn)輸條件 |
| 組織 | ＞50mg | 1.RNA later； 2.存入凍存管; 3.大塊組織樣本不建議放入trizol保存； 4.1.5ml無菌離心管 | -80℃保存，干冰運(yùn)輸 |
| 細(xì)胞 | ＞2 x 10^6 | 1.收集的細(xì)胞沉淀，加入1ml trizol震蕩混勻-80度保存； 2.收集的細(xì)胞沉淀，液氮速凍5-10min，-80℃冰箱保存； | -80℃保存，干冰運(yùn)輸 |
| 全血 | ＞1ml | A.采用EDTA抗凝管采血，禁用肝素抗凝管，新鮮血液效果更佳。 B.或者分離出PBMC加 trizol 混勻。 C.或者全血離心去掉血漿加 trizol 混勻。 D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube靜脈真空采血管（全血RNA管） PS：請(qǐng)盡量不使用RNA later保存全血。 | -80℃保存，干冰/4度（新鮮）運(yùn)輸 |
| FFPE | A.切片組織面積大于1cm2，切片表面無劃痕，無干裂，均勻貼片的石蠟切片； B.切片組織細(xì)胞>30000個(gè)；有核細(xì)胞比例>80%；腫瘤細(xì)胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上，需提供5-12片； C.石蠟塊：厚度4mm以上，組織約綠豆大小以上； D.蠟卷：厚度25um左右，2-5卷 | / | 4℃或常溫保存和運(yùn)輸 |
| RNA | ＞1ug | DEPC水；Water Nuclease-Free | -80℃保存，干冰運(yùn)輸 |
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