Visium HD(高分辨率)空間轉(zhuǎn)錄組測序
技術(shù)原理

1. 空間位置標(biāo)記 Visium HD的空間基因表達芯片有2個捕獲區(qū)。每個捕獲區(qū)域為6.5x6.5mm。捕獲區(qū)有~1100萬個基因表達spot點,每個點包括標(biāo)記空間位置的Spatial Barcode,以追溯RNA來源位置信息。
2. 全基因組探針捕獲 同單細胞Fixed RNA方案,Visium HD空轉(zhuǎn)也使用全基因組探針靶向雜交捕獲的方式,探針由左右臂組成,只有左右臂同時靶定目的區(qū)域才能進行連接被膠珠上的Poly(dT)VN捕獲。
基于以上兩點,單鏈連接產(chǎn)物在RNase處理和透化后從組織中釋放出來,然后在空轉(zhuǎn)載玻片上被捕獲。一旦連接產(chǎn)物被捕獲,探針經(jīng)過延伸后被添加上UMI、Spatial Barcode和Read1T。最終生成帶有空間條形碼的探針產(chǎn)物,繼續(xù)用于測序文庫的制備。
注意事項 暫時僅可支持人和小鼠,若需要做其他物種,可聯(lián)系我們做新鮮速凍組織空轉(zhuǎn)(一代)。
實驗流程
產(chǎn)品優(yōu)勢

研究方向

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