單細(xì)胞ATAC測序簡介
染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測序(ATAC-Seq)是確定全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)可及性的常 用方法。 ATAC-Seq可以對開放的染色質(zhì)區(qū) 域進(jìn)行測序,并以此來了解染色質(zhì)包裝和其他因素如何影響基因的表達(dá)。
實驗原理
進(jìn)行ATAC-Seq時,基因組DNA會暴露在高 活性轉(zhuǎn)座酶Tn5中。 Tn5會優(yōu)先插入到開放染 色質(zhì)位點,使DNA片段化,并同時添加測序 引物(該過程名為轉(zhuǎn)座酶片段化)。測序的 DNA即代表開放的染色質(zhì),可通過數(shù)據(jù)分析 深入了解基因調(diào)控。此外, ATAC-Seq還可 以與RNA測序等其他方法相結(jié)合,作為多組 學(xué)方法來研究基因的表達(dá)
實驗流程
數(shù)據(jù)性能
1.敏感性和特異性高
2.重現(xiàn)性高