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單細(xì)胞ATAC測序
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  • 單細(xì)胞ATAC測序簡介

    染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測序(ATAC-Seq)是確定全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)可及性的常  用方法。 ATAC-Seq可以對開放的染色質(zhì)區(qū)  域進(jìn)行測序,并以此來了解染色質(zhì)包裝和其他因素如何影響基因的表達(dá)。


    實驗原理

    進(jìn)行ATAC-Seq時,基因組DNA會暴露在高  活性轉(zhuǎn)座酶Tn5中。 Tn5會優(yōu)先插入到開放染 色質(zhì)位點,使DNA片段化,并同時添加測序 引物(該過程名為轉(zhuǎn)座酶片段化)。測序的  DNA即代表開放的染色質(zhì),可通過數(shù)據(jù)分析 深入了解基因調(diào)控。此外,  ATAC-Seq還可   以與RNA測序等其他方法相結(jié)合,作為多組  學(xué)方法來研究基因的表達(dá)

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    實驗流程



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    數(shù)據(jù)性能

    1.敏感性和特異性高

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    2.重現(xiàn)性高

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