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產(chǎn)品描述

單細(xì)胞Fixed RNA為10x Genomics于2022年3月推出的新產(chǎn)品，采用4%的PFA對細(xì)胞進(jìn)行固定，鎖定RNA的表達(dá)狀態(tài)，建庫時通過探針雜交捕獲基因，可覆蓋18,000多個基因，解決了單細(xì)胞樣本儲存、多樣本批量處理以及混樣測序的問題，讓單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的研究更加靈活。
    Fixed RNA可以保留脆弱細(xì)胞或動態(tài)的生物學(xué)狀態(tài)，將分析擴(kuò)展到更多樣本，樣本固定后集中處理，在同一次運(yùn)行中批量操作實(shí)驗(yàn)和分析，最大限度減少實(shí)驗(yàn)可變性和批次效應(yīng)，單通道中最多可混16個樣品，每個樣本捕獲8,000-10,000細(xì)胞，單張芯片最多可混128個樣本，最多可得1,024,000個細(xì)胞，混樣大大降低實(shí)驗(yàn)成本。

產(chǎn)品優(yōu)勢

• 擴(kuò)大了樣本范圍：能對FFPE細(xì)胞和組織，以及PFA固定樣本進(jìn)行單細(xì)胞測序分析，而不再受限于是否有新鮮組織可用，可以解鎖大量儲存在醫(yī)院以及生物樣本庫中的 FFPE 樣本的寶貴信息。

• 提升了低表達(dá)基因檢測靈敏度：特異性的探針設(shè)計，根據(jù)Flex和3’轉(zhuǎn)錄組的實(shí)測對比數(shù)據(jù)結(jié)果，在多種樣本類型中，相同的測序數(shù)據(jù)量下，F(xiàn)lex所得的測序數(shù)據(jù)飽和度更高，探針靈敏度更強(qiáng)，單個細(xì)胞內(nèi)可以檢測到的基因數(shù)更多。

• 減少了樣本采集運(yùn)輸難度：采集方面，樣本的及時固定，可使取樣更靈活，擴(kuò)散到多個采集點(diǎn)的同時減少取樣時間限制。運(yùn)輸方面，長距離運(yùn)輸?shù)膲毫ψ冃?，也適合多中心合作的應(yīng)用場景。

• 降低批次效應(yīng)：對于獲取時間不規(guī)律的腫瘤樣本、發(fā)育生物學(xué)中同一來源不同時間點(diǎn)的樣本、治療預(yù)后相關(guān)的臨床樣本等場景中樣本分批次采集的情況，可以應(yīng)用Flex同批次進(jìn)行雜交建庫實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)梯度設(shè)置更準(zhǔn)確，同時降低結(jié)果可變性。

• 鎖定瞬時表達(dá)：對于異質(zhì)性較強(qiáng)，生物學(xué)狀態(tài)快速變化的樣本，其細(xì)胞離體后，可能會受到較多外界壓力和影響，F(xiàn)lex經(jīng)過PFA及時固定，已經(jīng)鎖定了樣本瞬時的表達(dá)狀態(tài)。非常適合瀕死樣本、多階段變化樣本、脆弱樣本、需先進(jìn)行病理分型的樣本等。

• 方便與Cytassist空轉(zhuǎn)聯(lián)合分析：Flex技術(shù)與Visium Cytassist空轉(zhuǎn)技術(shù)結(jié)合，通過同一套探針對同一FFPE樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組研究，基因表達(dá)一致性更高，數(shù)據(jù)聯(lián)合分析匹配性更好。

實(shí)驗(yàn)流程