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單細(xì)胞免疫組庫
Single Cell Immune Profiling
單細(xì)胞免疫分析解決方案可以在單細(xì)胞水平獲得全長、配對的 V(D)J 序列，獲得樣本的免疫組庫，以便發(fā)現(xiàn)和疾病相關(guān)的抗體類型。
技術(shù)原理

（10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為例）


1. 形成GEMs 基于微流控芯片形成油包水（GEMs），每個油包水內(nèi)含有一個細(xì)胞、一個gel bead以及逆轉(zhuǎn)錄需要的引物試劑和酶等，單個GEM內(nèi)可進(jìn)行獨(dú)立逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)互不干擾。 

2. 標(biāo)記細(xì)胞和RNA分子 Gel bead上帶有標(biāo)簽，GEMs進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄，可將10x barcode（10x BC，用來標(biāo)記細(xì)胞)、UMI（標(biāo)記本底RNA進(jìn)行定量）加在每個mRNA分子上。

3. 巢式PCR富集全長V(D)J序列 基于T細(xì)胞和B細(xì)胞VDJ序列設(shè)計巢式PCR引物，富集全長V(D)J序列

實(shí)驗(yàn)流程

     血液/組織   單細(xì)胞/核懸液                          GEMs形成             文庫構(gòu)建                  測序                      數(shù)據(jù)處理               數(shù)據(jù)可視化分析

 

（10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為例）

技術(shù)優(yōu)勢

1）可實(shí)現(xiàn)成對的重鏈和輕鏈（B細(xì)胞）或α和β鏈（T細(xì)胞）的全長測序；
2）精細(xì)到單細(xì)胞水平，能獲得大量單細(xì)胞的免疫組庫數(shù)據(jù)；
3）同批樣本可同時獲得mRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)和免疫組庫數(shù)據(jù)；

單細(xì)胞平臺兼容性


數(shù)據(jù)分析

分析流程



分析結(jié)果展示
                       單細(xì)胞質(zhì)控                                       克隆型分析                                        轉(zhuǎn)錄組和TCR/BCR聯(lián)合分析


研究方向

1）抗體的鑒定和新抗體的發(fā)現(xiàn)
2）揭示Ig 庫的發(fā)展，繪制全局Ig 庫
3）研究傳染性疾病，如感染發(fā)展中的抗體進(jìn)化譜系等
4）研究免疫失調(diào)疾病的V(D)J 重組傾向性，尋找免疫失調(diào)疾病的標(biāo)記物
5）癌癥早期檢測、癌癥進(jìn)程和復(fù)發(fā)診斷的標(biāo)記物以及腫瘤免疫機(jī)制的研究

文獻(xiàn)案例

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